Pomocou an elektrická pumpa na fľašu vody môže určite obmedziť priamy kontakt medzi čerpadlom a vodou. Elektrické čerpadlá na fľaše na vodu bežne používajú automatizované vodné čerpadlá, ktoré pracujú tak, že prenášajú súčasnú dobu na motor čerpadla prostredníctvom zdroja sily, čo spôsobuje, že motor začne fungovať, po čom sa rám čerpadla otáča a vytvára kĺzanie vody. Pri tomto postupe samotné teleso čerpadla teraz neprichádza do priameho kontaktu s vodou, ale skôr nasáva vodu z jedného konca a potom ju vypúšťa z opačného konca cez systémy spolu s potrubím.
Toto usporiadanie, ktoré nie je najefektívnejšie, znižuje možnosť kontaktu medzi telom čerpadla a vodou, čím sa znižuje riziko hrdze alebo poškodenia tela čerpadla, ale tiež robí používanie elektrických čerpadiel na fľašu hygienickejším a praktickejším. Vzhľadom na to, že telo čerpadla už neprichádza do priameho kontaktu s vodou, zabraňuje tiež znečisťovaniu tela čerpadla kvôli problémom s prvotriednou vodou, čím je zaistená bezpečnosť prijímania vody.
